狼樱的蜜月只有两个月，两个月以后，俩人分别收到了修真学校和魔法学校的邀请，邀请函上写得很清楚两人能够在修真学校和魔法学校修到博士学位。收到邀请函的狼樱分别准备，毕竟两人才刚上高一，还有很多课程要补。
魔法学校的建筑多风格并存，校长热情地接待了小樱，小樱跟校长说，自己为了完成爸爸交给自己的事业，而需要进一步的学习。
校长领小樱去一处学校的秘密基地，那里的树木别有一番风味。
校长说了这里的传说刀剑神域诞生了世界之树，这树不断流传，到了约会大作战，这棵树进化成生命之树，树继续生长，到了型月世界，艾尔梅把它做成了知识树。树继续传播，到了军姬那里，把树发展成森罗万象的社会树。树继续发展，成了无限系统树。但是，知识能够分享，智慧却不能分享，美少女战士的木野真琴，用她荆棘树状的招式，用树状的电流传递着人类的智慧。木叶的忍者以树之芳香传递着心灵治疗之力。
小樱啊，校长慈祥的目光望着她，你的任务就是，在博士毕业之时，拿到最顶端的树枝，那里是智慧之树，它把如人类大脑的神经网络连接起来，连接着社会网络、星球网络。因为现世如教育般培养着树，正在走向基因工程的树。